Siglo XXI
En 2000, Ducati lanzó la MH900e, vendida exclusivamente por Internet. En pocas semanas se recibieron más de 2000 reservas del modelo. A partir de entonces, la compañía acercó su diseño a los compradores mediante campañas, ferias, concentraciones y aniversarios. Un ejemplo de esto fue el desarrollo del modelo Multistrada, en el que los consumidores aportaron ideas sobre el diseño.
En 2002, la sucesora de la 998, la 999, salió a la luz con un diseño rompedor, seguido por la 749, hermana menor de la 999. Durante estos años, Ducati consiguió victorias en los campeonatos de Superbike y en 2003 debutó en MotoGP con resultados sorprendentes.
En 2006, bajo la propiedad de Investindustrial, Ducati presentó la Desmosedici RR, edición limitada legal para carretera derivada de MotoGP. Al año siguiente se lanzó la 1098, sustituta de la 999, recuperando un diseño más clásico Ducati, con elementos característicos como salida doble de escape elevado, basculante monobrazo, frenos monobloque y 160 CV para el bicilíndrico más potente.
En 2007, Ducati presentó la Hypermotard 1100, un concepto rompedor y muy llamativo que ganó el premio a la motocicleta del Salón de Milán. Ese mismo año, Ducati ganó el Campeonato del Mundo de MotoGP con la Desmosedici pilotada por Casey Stoner, colocándose en lo más alto después de 33 años.
Más adelante en 2007, se lanzó la 848, sustituta de la 749, y la nueva Monster 696, con un diseño moderno y actualizado que mantenía guiños a su antecesora. En 2008, Ducati comercializó la 1098R, primera bicilíndrica de calle con más de 180 CV y control de tracción de serie, consolidando su dominio en Superbikes.